Zákon znižuje minimálny počet členov potrebných na registráciu cirkvi alebo náboženskej spoločnosti z doterajších 50 000 na 150 dospelých osôb s trvalým pobytom na Slovensku (pričom už nie je podmienkou slovenské občianstvo). Zároveň zavádza dvojstupňový systém: po prvom stupni (150 členov) cirkev získa základné práva – napríklad zhromažďovať sa, vyučovať vlastných duchovných či nadväzovať zahraničné kontakty. Druhý stupeň registrácie, ktorý otvára prístup k tzv. osobitným právam, môže cirkev získať až po minimálne 5 rokoch nepretržitej registrácie, každoročnom zverejňovaní výročných správ a dosiahnutí členstva aspoň 1 promile obyvateľov SR (čo pri súčasnom počte obyvateľov predstavuje približne 5 459 osôb). Medzi osobitné práva patrí napríklad vyučovanie náboženstva na školách, zriaďovanie vlastných škôl, zdravotníckych a sociálnych zariadení, duchovná služba v armáde a zboroch či čerpanie finančnej podpory zo štátneho rozpočtu. Všetky registrované cirkvi budú povinné každoročne do 31. marca zverejňovať výročnú správu o svojej činnosti a financovaní. Cirkvi registrované pred 1. januárom 2025 sa automaticky považujú za subjekty s oprávnením na výkon osobitných práv. Zákon tiež výslovne zakazuje, aby sa výkon náboženskej slobody využíval na obmedzovanie práv iných osôb, podnecovanie nenávisti alebo podporu násilia. Zákon nadobúda účinnosť 1. januára 2025.