Zákon predlžuje lehotu, do ktorej musia vlastníci malých domových čistiarní odpadových vôd (do 50 ekvivalentných obyvateľov) požiadať o zosúladenie svojho povolenia s novými pravidlami. Pôvodná lehota bola do 1. januára 2024, nová lehota je do 31. decembra 2028. Dôvodom je, že podrobné technické požiadavky – kategórie čistiarní a prípustné hodnoty znečistenia – boli prijaté nariadením vlády až v novembri 2022, teda s oneskorením oproti samotnej novele vodného zákona platnej od januára 2022. Vlastníci malých čistiarní (najmä domových, pre 2–6 obyvateľov) tak nemali dostatok času zistiť, do akej kategórie ich zariadenie patrí a aké limity musia splniť. Zároveň štátna vodná správa na okresných úradoch nemá kapacity na rýchle prehodnotenie desiatok tisíc existujúcich povolení. Bez predĺženia lehoty by vlastníci čistiarní s platnými povoleniami konali protizákonne a hrozili by im sankcie. Zákon nadobúda účinnosť 31. decembra 2023.