Zákon dopĺňa slovenské pravidlá systému obchodovania s emisnými kvótami skleníkových plynov, aby splnil požiadavky EÚ, ktoré Slovensko doteraz nesprávne alebo neúplne prenieslo do vnútroštátneho práva. Európska komisia preto voči Slovensku začala dve konania o porušení povinnosti, pričom hrozili finančné sankcie. V oblasti leteckej dopravy sa do konca roka 2026 zavádzajú prechodné výnimky: lety výlučne v rámci Európskeho hospodárskeho priestoru (okrem letov do Spojeného kráľovstva a Švajčiarska) sú dočasne oslobodené od povinnosti odovzdávať emisné kvóty; zároveň sa o zodpovedajúci podiel znižuje množstvo kvót určených na aukciu. Malí leteckí prevádzkovatelia s ročnými emisiami do 25 000 ton CO₂ môžu využiť zjednodušený nástroj na odhadovanie spotreby paliva namiesto plného overovania emisií. V oblasti lodnej dopravy sa do konca roka 2030 zavádzajú viaceré dočasné úľavy: lode ľadovej triedy IA alebo IA Super môžu odovzdať o 5 % menej kvót, než zodpovedá ich skutočným emisiám; osobné lode a lode ro-pax plávajúce medzi určenými prístavmi, ako aj lode prevádzkované v rámci nadnárodných zmlúv o službách vo verejnom záujme, sú od povinnosti odovzdávať kvóty úplne oslobodené; to isté platí pre plavby medzi prístavmi v najvzdialenejších regiónoch členských štátov EÚ. Zákon nadobúda účinnosť 1. júla 2026.